形成方式不同。高压苗是通过高压处理而形成的苗木；嫁接苗则是将两个不同的植物相连而形成的新的植株。

生长情况不同。高压苗没有主根，依靠侧根，不抗风吹、寿命短，但结果快；嫁接苗有主根，抗风能力强，寿命更长，但结果慢。

抗病能力有差异。嫁接苗抗病能力更强，因为它是由两个不同的植物组合而成，新植物具有两者的优点；高压苗通过促进根系发育，使树木增强了自身的抗逆能力。

适用对象不同。嫁接苗在果树、蔬菜、花卉等植物的繁殖和栽培中使用较多；高压苗更适合大型落叶乔木等树木的快速繁殖。